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「如果產生院內感染，關閉病房的SOP？如果發生院內大量感染，關閉醫院的SOP？」陳時中回應，分成兩個方式：「先將院內各個病房清空，現在病房都分倉，如果有內部感染就清空，移到別的病房；如果一個醫院的病房沒辦法完全擔負起，就移到院外。」

吳斯懷稍早於國是論壇抱怨，「基層人力在醫院的分流，造成組織工作時間延宕；有民眾抱怨看診等很久。」陳時中備詢時說明：防治預算編列196億，法案第二條裡有醫事人員的獎助跟補償；另外，機構也會有獎勵，比如現在「鼓勵分流、分倉」等相關措施。

對於吳斯懷所言，台灣兒童感染症醫學會理事長李秉穎接受《放言》詢問表示，「就是應該要分倉啊，分倉怎麼會延宕？那個延宕是因為我們很多醫院都管制進出，看起來並沒有延宕，因為現在醫院的病人數其實都減少了。病患到大醫院人數明顯減少，看診並不會有延遲的現象。」

吳斯懷今於國是論壇時間發言，稱：「基層人力在醫院的分流，造成組織工作時間延宕；每個醫院本來有既定的SOP，但後來加入要量體溫等流程，是造成醫護和民眾的麻煩，有些人抱怨看診等很久。」

石崇良說明，「分倉管理」就是為了以防萬一發生院內感染，尤其現在越來越多無症狀的感染者，或者是病患的自覺症狀極輕微，跟過去的SARS不一樣，因此院內感染機率非常高、難以避免。